
단백질 간 상호작용(PPI) 빅데이터 바이오 기업인 프로티나가 상장을 위한 IPO에 들어갑니다. 프로티나의 공모주 청약 정보를 소개하고, 증권신고서와 투자설명서를 바탕으로 프로티나 공모주 분석 내용을 공유하겠습니다.
📣 프로티나 기업 소개
프로티나는 단백질-단백질 상호작용(이하 ‘PPI’)을 관측하고 분석하는 단백질 빅데이터 기업입니다.
PPI(Protein-Protein Interaction) 란?
- Protein-Protein Interaction: 단백질-단백질 상호작용을 의미
- 세포 내에서 단백질들이 서로 결합하여 다양한 생물학적 기능을 수행하는 것을 의미함
- PPI는 신호 전달, 유전자 발현 조절, 대사 과정 등 다양한 생명 현상에서 중요한 역할을 함

프로티나 생산 제품
프로티나는 PPI 측정 및 분석을 위한 독자적인 기술을 바탕으로 SPID 플랫폼을 개발하였으며, 이 플랫폼은 PPI 전용 분석 칩 ‘Pi-Chip’, 고속 검출 장비 ‘Pi-View’, 자동 검출 및 분석 소프트웨어 ‘Pi-InSight’로 구성되어 있습니다.
당사는 SPID 플랫폼을 기반으로 현재까지 총 3개의 제품군을 상용화하였습니다. 2020년에 PPI 바이오마커 개발 솔루션 ‘PPI PathFinder™‘, 2024년에는 항체 최적화 및 PPI 빅데이터 생성 솔루션 ‘PPI Landscape™‘을 출시하였으며, SPID 플랫폼의 상용화 장비를 출시하면서 신약 개발 전주기에 걸쳐 당사의 기술을 활용한 솔루션과 장비를 공급하고 있습니다.

프로티나 주요 제품 매출 비중
프로티나의 제품 및 서비스 중 SPID 플랫폼의 매출 비중의 약 75%로 높습니다.

📅 프로티나 공모주 분석
프로티나 공모주 청약 일정
프로티나의 공모주 청약은 2025.07.18부터 시작되고, 2025.07.29 상장됩니다.
| 수요예측일 | 2025.07.08 ~ 07.14 |
| 공모청약일 | 2025.07.18 ~ 07.21 |
| 환불일 | 2025.07.23 |
| 납일일 | 2025.07.23 |
| 상장일 | 2025.07.29 |
프로티나 공모 개요
프로티나의 공모가는 14,000 원으로 확정되었습니다.
| 희망 공모가격 | 11,000 원 ~ 14,000 원 |
| 희망 공모금액 | 165 억원 ~ 210 억원 |
| 확정 공모가격 | 14,000 원 |
| 확정 공모금액 | 210 억 원 |
| 증권회사 | 한투자증권 |
| 공모주식수 | 1,500,000 주 | 모집 100% |
| 전문투자자 | 1,099,650 주 | 73.31 % |
| 우리사주조합 | 25,350 주 | 1.69 % |
| 일반청약자 | 375,000 주 | 25 % |
| 해외투자자 | 0 주 | 0% |
프로티나 공모자금 사용 목적
프로티나는 공모 자금을 통해 생산 및 연구개발(R&D) 역량을 고도화하여 임상 진단, 항체 최적화, AI 신약 설계까지 모두 아우르는 단백질 빅데이터 선도 기업으로 성장하고 글로벌 항체 설계 및 신약개발 시장에 진출하는 것을 목표로 하고 있습니다.


프로티나 수요예측 경쟁률
프로티나의 기관 단순 경쟁률은 1199 : 1로 흥행에 성공하였습니다.

프로티나 수요예측 가격 분포
프로티나의 수요예측 결과 희망공모가 밴드 상단인 14,000 원 이상 비율이 99.14 %의 높은 흥행을 기록했습니다.

프로티나 의무보유 확약
프로티나는 공모주 신청수량 기준 8.11%가 의무보유 확약을 신청하는 높은 흥행 성적을 기록했습니다.

프로티나 공모후 주주 구성
프로티나의 대주주 및 특수관계인 지분율이 23.02% 입니다.
프로티나 보호예수 및 프로티나 유통 물량
프로티나의 보호예수 물량은 68.51 %이고,
프로티나의 유통가능 물량은 31.49% 입니다. (프로티나의 구주매출 물량은 17.81 % )
프로티나 재무제표

📋 프로티나 비교기업 선정
대표주관회사인 한국투자증권㈜는 상기 선정기준을 충족하는 최종적으로 총 4개 기업(드림씨아이에스, 씨엔알리서치, Danaher, Revvity)을 최종 비교대상회사로 선정하였습니다.


🌈 프로티나 전망
세계 최초로 단일분자 수준의 PPI 분석 플랫폼인 ‘SPID’를 상용화
프로티나는 세계 최초로 단일분자 수준의 PPI 분석 플랫폼인 ‘SPID’를 상용화했습니다. 이 기술은 정제 과정 없이 단백질 상호작용을 고속으로 분석하여 정확하고 민감도 높은 데이터를 제공합니다.
- PPI PathFinder™: 임상용 바이오마커 개발 플랫폼으로, 미국 FDA의 ‘Project Optimus’ 가이드라인에 부합하여 약물 반응성 예측, 최적 투약 용량 결정, 동반진단 등 다양한 목적으로 활용됩니다. 특히 혈액암 치료제 베네토클락스의 반응 예측 진단 제품을 2026년 미국 CLIA 인증 랩 인수를 통해 세계 최초로 출시할 계획입니다.
- PPI Landscape™: 항원-항체 간 PPI 빅데이터를 기반으로 항체를 빠르게 최적화하고 재설계할 수 있는 솔루션으로, 항체 신약 개발의 속도와 성공률을 크게 높일 수 있습니다.

PPI 빅데이터를 활용한 항체 설계 AI 플랫폼 상용화
2024년 4월 프로티나는 클라우드항체구축 국가과제에 선정되어 주당 5,000건 이상의 항체-항원 단백질 상호작용(PPI) 데이터를 생산하고 있으며, 이를 바탕으로 공동연구자인 서울대학교 백민경 교수(2024년 노벨화학상 수상 RoseTTAFold AI 논문의 주요 개발자/제1저자)와 함께 AI 기반 항체 설계를 위한 고도화된 알고리즘을 개발 중입니다.
프로티나는 2026년부터 과학기술정보통신부 정부과제인 “클라우드 인공지능 항체은행”을 통해 개발한 “항체 신약설계 AI 플랫폼”을 출시하고, 인력과 자원을 점진적으로 신약 개발 분야로 재배치할 계획입니다.
이를 바탕으로, 제약사들과의 항체 신약 “공동개발” 확대 및 자체 항체 신약물질 개발 파이프라인 구축을 통한 항체 신약물질 “자체개발”사업도 중장기적으로 추진해 나갈 예정입니다.

해외 및 글로벌 파트너사와의 협업
당사는 Global Top 5 美A사, Global Top 10 歐R사, Global Top 20 亞T사, Global Top 40 歐S사 등 글로벌 제약사를 주요 고객사로 확보하고 있으며, 이들과의 공동연구 및 서비스 계약을 통해 수익을 창출하고 있습니다.
특히 신약 개발 전주기에 걸쳐 예측 바이오마커 발굴을 위한 맞춤형 assay를 제공하고 있으며 이는 비임상 및 임상 단계에서 반복적으로 활용될 수 있어 장기적인 매출원으로 이어질 수 있습니다.
당사는 해당 제약사의 파이프라인 및 연구 목적에 최적화된 솔루션을 제안하고, 이를 바탕으로 글로벌 파트너십을 확장하고 있습니다.

☄️ 프로티나 위험요소
목표시장 내 경쟁심화 위험
단백질 분석 및 신약 개발 분야는 전 세계적으로 경쟁이 치열하며, AI 기술 발전 등으로 인해 기술 변화가 빠르게 일어납니다.
당사의 PPI PathFinder 제품(바이오마커 분석솔루션 서비스)은 고민감도와 높은 정확도를 기반으로 신약 개발 과정의 바이오마커 분석 및 진단법으로 포지셔닝 하고 있습니다.
다만 최근 단백체 시장에서 전통적 방법론이 갖는 한계를 극복하는 경쟁사들이 등장하고 있습니다. 스웨덴의 Olink Holdings, 미국의 Quanterix, 미국의 MSD(Meso Scale Discovery)는 기존의 질량분석과 면역분석법의 주요 한계를 개선하면서 당사와 같이 단백체학 연구의 효율성과 정밀성을 크게 높이고 있습니다. 현재 기술적으로 구현하지 못하고 있으나, 이들 신생기업들이 당사가 포지션닝하는 분야에 단백질분석 기술 혁신과 공격적인 마케팅을 주도할 경우 당사 제품에 대한 시장 경쟁이 심화될 수 있습니다.

당사의 PPI Landscape 솔루션은 항체 개량 및 최적화 사업과 나아가 AI를 활용한 신약 개발 플랫폼을 대상으로 삼고 있습니다.
해당 시장의 경쟁자로는 바이오층간섭계(Bio-Layer Interferometry, BLI)기술을 활용한 생체 분자 상호작용 분석 장비인 Octet 시스템을 제공하는 Sartorius 사가 있습니다.
Sartorius는 바이오 공정 전문 기업으로 제약사들이 치료용 항체 등의 바이오의약품을 안전, 신속, 경제적으로 개발, 생산할 수 있도록 연구개발, 세포 배양, 정제 등 통합된 기술을 제공하고 있습니다. 핵심 제품인 Octet BLI 시스템은 바이오분자 상호작용 분석을 위한 Label-free 분석 플랫폼으로 단백질-단백질, 항체-항원 등 생체분자간 결합 특성을 측정하는데 사용됩니다. 특히 고속으로 결합 동역학 및 농도 분석을 수행할 수 있어 다수의 글로벌 제약사들에 채택되어 사용되고 있습니다.

지속적인 적자 및 흑자 전환 불확실성
프로티나는 현재 적자 상태이며, 2027년 흑자 전환을 목표로 하고 있습니다. 그러나 바이오 산업의 특성상 연구개발 비용이 많이 들고, 임상 시험 성공 여부 등 불확실성이 크기 때문에 목표한 시점에 흑자 전환이 어렵거나, 흑자 규모가 기대에 못 미칠 수 있습니다.

2024년 대비 2028년까지 약 25배 이상 매출을 확대하겠다는 사업계획에 근거한 추정손익 미달성 위험
당사는 단백질간 상호작용 바이오마커 개발 및 분석서비스를 제공하는 기업으로서 업종 특성상 높은 연구개발비 지출로 설립이후 적자를 기록했지만, 현재 주력 제품인 PPI PathFinder 및 PPI Landscape의 고객사 증대에 따라 향후 매출 규모가 점진적으로 증가할 것으로 예상됩니다.
프로티나는 2024년 대비 2028년까지 약 25배 이상 매출을 확대하겠다는 공격적인 목표를 제시하고 있습니다.
하지만, 바이오 기업의 실적은 임상 결과, 기술 이전 계약 성사 여부, 시장 상황 등 다양한 변수에 의해 크게 좌우될 수 있습니다.

프로티나 주식매수선택권 행사에 따른 지분 희석 위험
프로티나 주식매수선택권 행사에 따른 지분 희석 위험
증권신고서 제출일 현재 미행사 주식매수선택권은 715,725주입니다. 이는 공모 후 발행주식총수의 6.64%입니다.
향후 주식매수선택권의 행사로 인하여 신주가 발행되어 시장에 출회될 경우 당사의 상장 후주가에 희석화 요인으로 작용하여 주가에 부정적인 영향을 미칠 수 있습니다.
🧭 프로티나 공모주 청약 할까 말까? (내용 정리)
- 단백질 간 상호작용(PPI) 빅데이터 바이오 기업
- 기관 단순 경쟁률은 기관 단순 경쟁률은 1199 : 1로 흥행에 성공
- 희망공모가 밴드 상단인 14,000 원 이상 비율이 99.14 % 로 14,000 원 공모가 확정
- 유통가능 물량은 31.49%(구주매출 물량은 17.81% )
개인 의견 : 청약 참여
❓ 프로티나 공모주에 대해 궁금한점 있나요?
프로티나는 어떤 회사인가요?
프로티나는 단백질 간 상호작용(PPI)을 정밀하게 분석하는 독자적인 기술인 ‘SPID 플랫폼’을 기반으로, 질병 진단용 바이오마커 개발 및 신약 개발을 돕는 바이오 기업입니다.
핵심 기술인 ‘SPID 플랫폼’이 무엇인가요?
SPID는 단일 분자 수준에서 단백질 간 결합을 초고속으로 분석하는 기술입니다. 기존 방식보다 훨씬 민감하고 정확하며, 정제 과정 없이 혈액 등 생체 시료를 바로 분석할 수 있다는 장점이 있습니다.
프로티나 공모주 전망은 어떻게 될꺼 같나요?
장기적으로는 SPID 플랫폼의 상용화 성공과 바이오마커, 신약 개발 파이프라인의 성과에 따라 긍정적일 수 있습니다. 다만, 단기적으로는 시장 상황, 기술 특례 상장 기업에 대한 투자 심리, 그리고 투자자 보호 예수 물량 출회 가능성 등 여러 변수에 따라 변동성이 클 수 있습니다.


